| 試合日時 | 大会概要 | 試合結果 | スタジアム |
|---|---|---|---|
| 2021/03/14(日) 13:00 |  第1節 |  MIOびわこ滋賀  奈良クラブ | 東近江 |
| 2021/03/20(土) 14:30 | 第2節 |  FCティアモ枚方 MIOびわこ滋賀 | 枚方 |
| 2021/03/28(日) 13:00 | 第3節 | MIOびわこ滋賀  ヴィアティン三重 | 東近江 |
| 2021/04/04(日) 13:00 | 第4節 |  ホンダロックSC MIOびわこ滋賀 | 宮崎県 |
| 2021/04/11(日) 13:00 | 第5節 | MIOびわこ滋賀  FC刈谷 | 東近江 |
| 2021/04/18(日) 11:00 | 滋賀FA杯 準決勝 | MIOびわこ滋賀  守山侍2000 | ビッグレイクC |
| 2021/04/24(土) 13:00 | 第6節 |  東京武蔵野ユナイテッドFC MIOびわこ滋賀 | 武蔵野 |
| 2021/05/05(水) 13:00 | 第8節 |  F.C.大阪 MIOびわこ滋賀 | 花園第2G |
| 2021/05/08(土) 13:00 | 滋賀FA杯 決勝 | MIOびわこ滋賀  びわこ成蹊スポーツ大学 | 東近江 |
| 2021/05/16(日) 13:00 | 第9節 | MIOびわこ滋賀  鈴鹿ポイントゲッターズ | 東近江 |
| 2021/05/23(日) 13:00 | 第7節 |  ラインメール青森 MIOびわこ滋賀 | 非公表 |
| 2021/05/30(日) 13:00 | 第10節 |  いわきFC MIOびわこ滋賀 | いわきGF |
| 2021/06/05(土) 13:00 | 第11節 | MIOびわこ滋賀  FCマルヤス岡崎 | 東近江 |
| 2021/06/13(日) 13:00 | 第12節 | MIOびわこ滋賀  高知ユナイテッドSC | 東近江 |
| 2021/06/19(土) 13:00 | 第13節 |  Honda FC MIOびわこ滋賀 | 都田 |
| 2021/06/26(土) 13:00 | 第14節 | MIOびわこ滋賀  松江シティFC | 東近江 |
| 2021/07/03(土) 13:00 | 第15節 |  ヴェルスパ大分 MIOびわこ滋賀 | 昭和電サA |
| 2021/07/18(日) 15:00 | 第17節 |  ソニー仙台FC MIOびわこ滋賀 | 石巻フ |
| 2021/07/25(日) 15:00 | 第18節 | MIOびわこ滋賀 FCティアモ枚方 | 東近江 |
| 2021/08/21(土) 16:00 | 第19節 | 奈良クラブ - MIOびわこ滋賀 | 奈良橿原 |
| 2021/08/28(土) 15:00 | 第20節 | MIOびわこ滋賀 - F.C.大阪 | 東近江 |
| 2021/09/04(土) 15:00 | 第21節 | 鈴鹿ポイントゲッターズ - MIOびわこ滋賀 | AGF鈴鹿 |
| 2021/09/12(日) 15:00 | 第22節 | MIOびわこ滋賀 - いわきFC | 東近江 |
| 2021/09/18(土) 13:00 | 第23節 | FCマルヤス岡崎 - MIOびわこ滋賀 | 豊橋 |
| 2021/10/03(日) 13:00 | 第24節 | 高知ユナイテッドSC - MIOびわこ滋賀 | 宿毛陸 |
| 2021/10/10(日) 13:00 | 第25節 | MIOびわこ滋賀 - Honda FC | 東近江 |
| 2021/10/17(日) 13:00 | 第26節 | MIOびわこ滋賀 - ヴェルスパ大分 | 東近江 |
| 2021/10/24(日) 13:00 | 第27節 | 松江シティFC - MIOびわこ滋賀 | 松江 |
| 2021/10/30(土) 13:00 | 第28節 | FC刈谷 - MIOびわこ滋賀 | 刈谷 |
| 2021/11/03(水) 13:00 | 第29節 | MIOびわこ滋賀 - ホンダロックSC | 東近江 |
| 2021/11/07(日) 13:00 | 第30節 | ヴィアティン三重 - MIOびわこ滋賀 | アサスタ |
| 2021/11/14(日) 13:00 | 第31節 | MIOびわこ滋賀 - ソニー仙台FC | 東近江 |
| 2021/11/27(土) 13:00 | 第33節 | MIOびわこ滋賀 - ラインメール青森 | 東近江 |
| 2021/12/05(日) 13:00 | 第34節 | MIOびわこ滋賀 - 東京武蔵野ユナイテッドFC | 甲賀 |